BigWig és un format de fitxer per mostrar dades denses i contínues en una pista del navegador del genoma, creat mitjançant la conversió del format Wiggle (WIG). El format BigWig es descriu al lloc web de la UCSC Genome Bioinformatics, i la guia de formats de fitxers del Broad Institute proporciona informació addicional.
Què és el format bigWig?
El format bigWig és per mostrar dades denses i contínues que es mostraran com a gràfic Els fitxers BigWig es creen inicialment a partir de fitxers de tipus WIG, utilitzant el programa UCSC wigToBigWig. Alternativament, els fitxers bigWig es poden crear a partir dels fitxers bedGraph, utilitzant el programa UCSC bedGraphToBigWig.
Com puc utilitzar el fitxer bigWig?
Mou el fitxer bigWig acabat de crear (myBigWig.bw) a una ubicació http, https o ftp accessible al web. Enganxeu l'URL al formulari d'entrada de la pista personalitzada o creeu una pista personalitzada amb una única línia de seguiment. Enganxeu la línia de la pista personalitzada al quadre de text de la pàgina de gestió de la pista personalitzada.
Què és una cançó de bigWig?
bigWig Tracks són tracks per a senyals continus a tot el genoma. Són adequats per mostrar diversos resultats d'experiments "crues", com ara senyals ChIP-Seq, senyals RNA-Seq, etc.
Com puc crear un fitxer bigWig?
Hi ha diverses maneres de generar fitxers grans. Això normalment implica convertir un. bam a una pista de moviment (. wig) i després convertint la pista de moviment en un bigwig (.
