SDS s'uneix fortament a els residus hidròfobs i carregats positivament de proteïnes a través dels seus grups sulfat i cadenes alquils , respectivament13 En conseqüència, és un detergent valuós en el camp de la biologia estructural i els estudis de plegament/desplegament de proteïnes.
Què fa SDS amb una proteïna?
SDS és un tensioactiu amfipàtic. desnatura les proteïnes en unir-se a la cadena de proteïnes amb la seva cua d'hidrocarburs, exposant les regions normalment enterrades i recobrint la cadena de proteïnes amb molècules de tensioactiu. El grup de capçal polar de SDS afegeix un benefici addicional a l'ús d'aquest desnaturalitzant.
Com s'uneix SDS als aminoàcids?
L'SDS té una cua hidrofòbica que interacciona fortament amb les cadenes de proteïnes (polipèptids). El nombre de molècules SDS que s'uneixen a una proteïna és proporcional al nombre d'aminoàcids que formen la proteïna Cada molècula SDS aporta dues càrregues negatives, aclaparant qualsevol càrrega que pugui tenir la proteïna.
L'SDS recobreix les proteïnes?
SDS també recobreix la proteïna amb una càrrega negativa uniforme, que emmascara les càrregues intrínseques dels grups R. SDS s'uneix de manera bastant uniforme a les proteïnes lineals (al voltant d'1,4 g de SDS/ 1 g de proteïna), el que significa que la càrrega de la proteïna és ara aproximadament proporcional al seu pes molecular.
Com SDS dóna una càrrega negativa a les proteïnes?
SDS és un detergent que conté una cadena alifàtica llarga i un grup sulfat. Aquest detergent interacciona amb proteïnes desnaturalitzades per formar un complex fortament carregat negativament (la càrrega negativa que sorgeix del SO42 − grups de SDS). Les proteïnes es desnaturalitzen primer per calor i després s'afegeix l'SDS en gran excés.
